MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 74307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008340	GCC	2	6	177585	177590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319315
4002	NC_008340	CAC	2	6	177701	177706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319315
4003	NC_008340	GCA	2	6	177722	177727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319315
4004	NC_008340	G	7	7	177741	177747	0 %	0 %	100 %	0 %	114319315
4005	NC_008340	GC	3	6	177756	177761	0 %	0 %	50 %	50 %	114319315
4006	NC_008340	CTA	2	6	177767	177772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319315
4007	NC_008340	ACC	2	6	177805	177810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319315
4008	NC_008340	CCG	2	6	177848	177853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319315
4009	NC_008340	TGA	2	6	177938	177943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319315
4010	NC_008340	TGCTGG	2	12	177976	177987	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114319315
4011	NC_008340	GCTG	2	8	178011	178018	0 %	25 %	50 %	25 %	114319316
4012	NC_008340	GCT	2	6	178054	178059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4013	NC_008340	GGGGCC	2	12	178066	178077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319316
4014	NC_008340	TGC	3	9	178080	178088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4015	NC_008340	GTG	2	6	178142	178147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4016	NC_008340	GGA	2	6	178165	178170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319316
4017	NC_008340	TGG	2	6	178191	178196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4018	NC_008340	CGG	2	6	178329	178334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319316
4019	NC_008340	TGG	2	6	178356	178361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4020	NC_008340	GC	4	8	178399	178406	0 %	0 %	50 %	50 %	114319316
4021	NC_008340	ACG	2	6	178449	178454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4022	NC_008340	TGG	2	6	178470	178475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4023	NC_008340	GGA	2	6	178492	178497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319316
4024	NC_008340	CTGGAG	2	12	178511	178522	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319316
4025	NC_008340	GCGCC	2	10	178531	178540	0 %	0 %	40 %	60 %	114319316
4026	NC_008340	CTG	2	6	178637	178642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4027	NC_008340	CTG	3	9	178667	178675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4028	NC_008340	TGG	2	6	178679	178684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4029	NC_008340	GCTG	2	8	178695	178702	0 %	25 %	50 %	25 %	114319316
4030	NC_008340	GTG	2	6	178703	178708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4031	NC_008340	CCA	2	6	178722	178727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319316
4032	NC_008340	CTG	2	6	178757	178762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4033	NC_008340	CAT	2	6	178798	178803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319316
4034	NC_008340	GCC	2	6	178804	178809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4035	NC_008340	GCT	2	6	178810	178815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4036	NC_008340	GAT	3	9	178834	178842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319316
4037	NC_008340	TGC	2	6	178860	178865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4038	NC_008340	CGC	2	6	178867	178872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4039	NC_008340	GGC	2	6	178906	178911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319316
4040	NC_008340	GGCCC	2	10	178924	178933	0 %	0 %	40 %	60 %	114319316
4041	NC_008340	ACC	2	6	178952	178957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319316
4042	NC_008340	GCC	2	6	178958	178963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4043	NC_008340	GGCCT	2	10	178964	178973	0 %	20 %	40 %	40 %	114319316
4044	NC_008340	TGG	2	6	179037	179042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4045	NC_008340	CCG	2	6	179043	179048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4046	NC_008340	GCT	2	6	179062	179067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4047	NC_008340	GCC	2	6	179068	179073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4048	NC_008340	GCA	2	6	179110	179115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4049	NC_008340	GCCGG	2	10	179172	179181	0 %	0 %	60 %	40 %	114319316
4050	NC_008340	GTG	2	6	179186	179191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4051	NC_008340	CGG	2	6	179196	179201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319316
4052	NC_008340	CTT	2	6	179266	179271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319316
4053	NC_008340	CGA	2	6	179272	179277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4054	NC_008340	GGA	2	6	179311	179316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319316
4055	NC_008340	GGT	2	6	179344	179349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4056	NC_008340	CTGG	2	8	179419	179426	0 %	25 %	50 %	25 %	114319316
4057	NC_008340	GCCC	2	8	179429	179436	0 %	0 %	25 %	75 %	114319316
4058	NC_008340	TGG	2	6	179469	179474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4059	NC_008340	GAG	2	6	179498	179503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319316
4060	NC_008340	ACG	2	6	179565	179570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4061	NC_008340	GTG	2	6	179588	179593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4062	NC_008340	CTCAAC	2	12	179624	179635	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	114319316
4063	NC_008340	CCG	2	6	179699	179704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4064	NC_008340	GCT	2	6	179761	179766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4065	NC_008340	GTG	2	6	179798	179803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
4066	NC_008340	GCT	2	6	179806	179811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4067	NC_008340	GCC	2	6	179852	179857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4068	NC_008340	TCT	2	6	179895	179900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319316
4069	NC_008340	CTG	2	6	179912	179917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4070	NC_008340	CTGG	2	8	179923	179930	0 %	25 %	50 %	25 %	114319316
4071	NC_008340	GAC	2	6	179978	179983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4072	NC_008340	TCC	2	6	179994	179999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319316
4073	NC_008340	GCC	2	6	180012	180017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4074	NC_008340	GC	3	6	180019	180024	0 %	0 %	50 %	50 %	114319316
4075	NC_008340	CGG	2	6	180033	180038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319316
4076	NC_008340	GCGG	3	12	180069	180080	0 %	0 %	75 %	25 %	114319316
4077	NC_008340	CCA	2	6	180087	180092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319316
4078	NC_008340	CTG	2	6	180116	180121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4079	NC_008340	CCCA	2	8	180143	180150	25 %	0 %	0 %	75 %	114319316
4080	NC_008340	GCG	2	6	180185	180190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319316
4081	NC_008340	CTG	2	6	180203	180208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4082	NC_008340	TGC	2	6	180210	180215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4083	NC_008340	GTGCTG	2	12	180221	180232	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114319316
4084	NC_008340	TCGCT	2	10	180655	180664	0 %	40 %	20 %	40 %	114319317
4085	NC_008340	CCTTCG	2	12	180676	180687	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114319317
4086	NC_008340	CGG	3	9	180703	180711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319317
4087	NC_008340	ATC	2	6	180714	180719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319317
4088	NC_008340	CGG	2	6	180745	180750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319317
4089	NC_008340	GCG	2	6	180757	180762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319317
4090	NC_008340	TTC	2	6	180858	180863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319317
4091	NC_008340	GGT	2	6	180906	180911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319317
4092	NC_008340	CCG	2	6	180913	180918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
4093	NC_008340	GGA	2	6	180930	180935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319317
4094	NC_008340	GCT	2	6	180965	180970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319317
4095	NC_008340	CGG	2	6	181000	181005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319317
4096	NC_008340	GCC	2	6	181014	181019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
4097	NC_008340	GTG	2	6	181029	181034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319317
4098	NC_008340	CCG	2	6	181036	181041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
4099	NC_008340	CAA	2	6	181061	181066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319317
4100	NC_008340	GTT	2	6	181073	181078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319317
4101	NC_008340	GCC	3	9	181122	181130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
4102	NC_008340	G	6	6	181139	181144	0 %	0 %	100 %	0 %	114319317
4103	NC_008340	GCC	3	9	181379	181387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
4104	NC_008340	CTT	2	6	181394	181399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319317
4105	NC_008340	CGA	2	6	181430	181435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319317
4106	NC_008340	CCAC	2	8	181471	181478	25 %	0 %	0 %	75 %	114319317
4107	NC_008340	CTG	2	6	181539	181544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319317
4108	NC_008340	CCT	2	6	181556	181561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319317
4109	NC_008340	GTGG	2	8	181566	181573	0 %	25 %	75 %	0 %	114319317
4110	NC_008340	CCG	3	9	181577	181585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319317
4111	NC_008340	TCC	2	6	182173	182178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
4112	NC_008340	CAT	2	6	182192	182197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319318
4113	NC_008340	GCC	2	6	182251	182256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
4114	NC_008340	GGT	2	6	182291	182296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319318
4115	NC_008340	TGG	2	6	182303	182308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319318
4116	NC_008340	CAC	2	6	182382	182387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319318
4117	NC_008340	CGG	2	6	182437	182442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
4118	NC_008340	GC	3	6	182455	182460	0 %	0 %	50 %	50 %	114319318
4119	NC_008340	GTCGCG	2	12	182466	182477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319318
4120	NC_008340	GGC	2	6	182487	182492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
4121	NC_008340	GTT	2	6	182493	182498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319318
4122	NC_008340	CGT	2	6	182510	182515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
4123	NC_008340	CCG	2	6	182558	182563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
4124	NC_008340	TCC	2	6	182614	182619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
4125	NC_008340	CCAG	2	8	182630	182637	25 %	0 %	25 %	50 %	114319318
4126	NC_008340	CGG	2	6	182672	182677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
4127	NC_008340	GTCGGC	2	12	182724	182735	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319318
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4129	NC_008340	GTC	2	6	182775	182780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
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4131	NC_008340	GGCTG	2	10	182924	182933	0 %	20 %	60 %	20 %	114319318
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4143	NC_008340	G	7	7	183218	183224	0 %	0 %	100 %	0 %	114319318
4144	NC_008340	CGGC	2	8	183370	183377	0 %	0 %	50 %	50 %	114319318
4145	NC_008340	CTT	2	6	183456	183461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319318
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4150	NC_008340	CCGG	2	8	183588	183595	0 %	0 %	50 %	50 %	114319318
4151	NC_008340	TGG	2	6	183617	183622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319318
4152	NC_008340	GCT	2	6	183629	183634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
4153	NC_008340	GC	3	6	183661	183666	0 %	0 %	50 %	50 %	114319318
4154	NC_008340	CGC	2	6	183692	183697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
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4232	NC_008340	GGT	2	6	186464	186469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319320
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4234	NC_008340	TGG	2	6	186568	186573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319320
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4237	NC_008340	CCT	2	6	186706	186711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319320
4238	NC_008340	GCA	2	6	186730	186735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319320
4239	NC_008340	CAG	2	6	186743	186748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319320
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4241	NC_008340	TCG	2	6	186834	186839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319320
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4359	NC_008340	ATGG	2	8	192174	192181	25 %	25 %	50 %	0 %	114319324
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4362	NC_008340	GCG	2	6	192283	192288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319324
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4481	NC_008340	GGC	2	6	198064	198069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319329
4482	NC_008340	CGG	2	6	198082	198087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319329
4483	NC_008340	GTC	2	6	198161	198166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319329
4484	NC_008340	GC	3	6	198235	198240	0 %	0 %	50 %	50 %	114319329
4485	NC_008340	GTC	2	6	198248	198253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319329
4486	NC_008340	CTG	2	6	198272	198277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319329
4487	NC_008340	GTA	2	6	198287	198292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319329
4488	NC_008340	CGT	2	6	198295	198300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319329
4489	NC_008340	CGG	2	6	198307	198312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319329
4490	NC_008340	CCA	2	6	198328	198333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319329
4491	NC_008340	GCG	2	6	198338	198343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319329
4492	NC_008340	CCT	2	6	198349	198354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319329
4493	NC_008340	TCC	2	6	198390	198395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319329
4494	NC_008340	GGA	2	6	198455	198460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319329
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4500	NC_008340	AGC	3	9	198732	198740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319329

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